Expressionsanalyse von tripartite-motif29 und tripartite-motif36 - zwei putative E3-Ligasen in der frühen Embryogenese von Xenopus laevis

Abstract

Die Familie der tripartite-motif-Proteine ist durch einen charakteristischen Aufbau aus RING-Domäne, B-Box-Domäne und Coiled-Coil-Domäne charakterisiert. Ihnen wird auf Grund ihrer RING-Domäne eine Rolle als E3-Ligase beim Ubiquitinierungsprozess zugeschrieben. Aus den über 70 Mitgliedern wurden für die folgende Analyse zwei tripartite-motif-Proteine ausgewählt, welche eine vermeintliche Funktion in der Differenzierung zwischen neuralem und nicht neuralem Ektoderm in Bezug auf den Modellorganismus Xenopus laevis aufweisen. Anhand von Xenopus-Embryonen wurde eine Expressionsanalyse für tripartite-motif29 und tripartite-motif36 unter Nutzung von PCR und whole mount in situ Hybridisierung durchgeführt. Für trim36 konnte die frühe Expression, wie bereits bekannt, während der Furchungsteilungen und während der Neurulation nachgewiesen werden. Zusätzlich erfolgte ein Nachweis in verschiedenen cerebralen Geweben des Embryos. Trim36 könnte hier eine Rolle in der Differenzierung verschiedener Nervenzellen spielen. Für trim29 konnte ein Nachweis im Oberflächenektoderm des Embryos bei ausbleibender Expression im Neuroektoderm nachgewiesen werden. Trim29 scheint wichtig für die Differenzierung des Oberflächenektoderms zu sein.

The family of tripartite-motif-proteins is characterized by a typical structure of three domains, a RING-domain, a B-BOX-domain and a coiled-coil-domain. Because of its RING-domain trim-proteins might play a role as E3-ligases during ubiquitination. For the following analysis we chose two members of the tripartite-motif-family which seems to have a function in differentiation between neural and non-neural ectoderm in the organism Xenopus laevis. Using Xenopus-embryos allows an analysis of the expression of tripartite-motif29 and tripartite-motif36. For this PCR-analysis and whole mount in situ hybridization was used. As known, for trim36 could have been showed that the gen is active while cleavage and neurulation. Furthermore I showed the expression of the gen in different neural tissues. Trim36 might play a role in differentiation of several neural cells. Expression of trim29 starts during gastrulation in the ectoderm. While neurulation trim29 is expressed in non-neural ectodem but not in neural ectoderm. You can suggest that trim29 plays a role in differentiation between neural and non-neural ectoderm.