Zentralitätsanalyse molekularbiologischer Netzwerke

Abstract

Das Ranking von Netzwerkelementen auf der Basis der Netzwerkstruktur ist eine anerkannte Methode zur Exploration neuer Netzwerke und zur Gewinnung von Hypothesen. Für die Analyse von Genregulationsnetzen und metabolischen Reaktionsnetzen, zwei Arten von molekularbiologischen Netzwerken, werden in dieser Dissertation je ein neues Zentralitätsmaß vorgestellt. Die Motiv-basierte Zentralität zur Analyse von Genregulationsnetzen verwendet zur Bewertung der Knoten des Netzes Informationen über die innerhalb des Netzes gefundenen Motive. Die Fluss-basierte Zentralität zur Analyse von metabolischen Reaktionsnetzen hingegen nutzt berechnete oder gemessene Flussverteilungen zur Bewertung der Knoten. Beide Zentralitätsmaße werden anhand einer Analyse je eines Netzwerkes für den Organismus E. coli demonstriert.