https://opendata.uni-halle.de//handle/497920112/159886 2026-04-13T15:16:19Z 2026-04-13T15:16:19Z Falke, Dörte https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8528 2026-01-30T09:53:52Z 2016-01-01T00:00:00Z

Title: Charakterisierung des aeroben und anaeroben Respirationssystems von Streptomyces coelicolor A3(2) Author(s): Falke, Dörte Abstract: Streptomycescoelicolor A3(2) zählt zu den hoch GC-reichen grampositiven Actinobacteria und ist bekannt für seinen komplexen Lebenszyklus, der vegetatives Substratmyzel, Luftmyzel und Sporen umfasst. Als obligater Aerobier nutzt das Bakterium Sauerstoff als terminalen Elektronenakzeptor. Zur Energiekonservierung unter aeroben Bedingungen werden die Elektronen über eine bislang wenig erforschte Atmungskette transferiert, die mit multiplen Cytochrom-Oxidasen endet. Obwohl S. coelicolor zum Wachstum O2 benötigt, enthält das Genom 3 Operone für respiratorische Nitratreduktasen (Nars). Damit kann S. coelicolor mit Nitrat atmen, wenn Sauerstoff nicht verfügbar ist. Der regulatorische Switch zwischen Sauerstoff- und Nitratatmung ist Gegenstand der vorliegenden Dissertation. Die Dissertation zeigt neue Aspekte zur aeroben Atmung und die Identifizierung einer neuen Sporen-spezifischenOxidase. Darüber hinaus werden alle dreiNars im Kontext des Lebenszyklus charakterisiert und eine putative Verbindung zur aeroben Atmung entdeckt.; StreptomycescoelicolorA3(2) belongs to the high-GC gram-positive actinobacteria and is characterized by undergoing a complex life-cycle, includingvegetative hyphae, aerial hyphae and spores. As an obligate aerobeS. coelicolorusesaerobic respiration for growth, butstudiesin this area arelimited. Theaerobic respiratorychain terminates with multiple cytochrome oxidases. Despite requiring oxygen for growth, the genome of S. coelicolor habours three operons encoding respiratory nitrate reductases (Nars). Thus,S. coelicolor is able to respire with nitrate when oxygen is not available. The regulatory switch between aerobic respiration and nitrate respiration during the lifecycleis the subject of this dissertation. This work reveals new aspects regarding aerobic respiration, identifying a new spore-specific oxidase.Moreover,all three Nars were analyzed in the context of the developmental programand a putative link between Nar1 and components of the aerobic respiratory chain in spores was established.

2016-01-01T00:00:00Z Nijenhuis, Ivonne https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/8460 2026-01-30T09:53:50Z 2016-01-01T00:00:00Z

Title: Characterisation of microbial transformation of halogenated organic contaminants using compound-specific stable isotope analysis Author(s): Nijenhuis, Ivonne Abstract: Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit der Untersuchung und Entwicklung von Konzepten, basierend auf der Analyse stabiler Isotope, um den Einfluss des natürlichen, biologischen Abbaus von halogenierten Schadstoffen im Grundwasser zu bewerten. Neben den bereits etablierten geochemischen - und Konzentrationsanalysen, sowie mikrobiologischer und molekularbiologischer Methoden und Techniken, bezieht diese Arbeit die komponentenspezifische Isotopenanalyse als komplementäre Methode mit ein. Die entwickelten Ansätze ermöglichen die qualitative und quantitative Untersuchung der in situ Aktivität von Mikroorganismen und finden Anwendung in der Charakterisierung der Dehalogenierungsreaktion in Organohalid respirierenden Bakterien.; In this work, concepts based on the application of stable isotope analysis were developed and investigated allowing assessing the contribution of biodegradation to natural attenuation of halogenated groundwater contaminants. Compound-specific stable isotope analysis can serve as a complementary tool to common geochemical and concentration analysis, microbiology and molecular biology and are discussed in relation to the biotransformation of halogenated groundwater contaminants. The concepts developed allow the investigation of the in situ activity of microorganisms, both qualitatively and quantitatively, and were used to characterize the dehalogenation reaction in organohalide-respiring bacteria.

2016-01-01T00:00:00Z Kosowski, Kornelia https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/7810 2026-01-30T09:53:49Z 2013-01-01T00:00:00Z

Title: Untersuchungen der Mikroorganismengemeinschaft im Prozess der Bioabfall-Kompostierung Author(s): Kosowski, Kornelia Abstract: Bioabfälle mit tierstämmigen Bestandteilen wurden in Bioreaktoren mit 400 l und 700 l Fassungsvermögen kompostiert. Es wurden 25 thermophile und 19 mesophile bis thermotolerante Bakterien aus verschiedenen Kompostierungsprozessen isoliert und ausgewählte Stämme als Starterkulturen näher untersucht. Die Diversität der Bakteriengemeinschaften von drei Kompostierungsprozessen wurde mittels Restriktionsanalyse amplifizierter 16S rRNA-Gene (ARDRA) untersucht. Mittels terminalem Restriktionsfragmentlängenpolymorphismus (t-RFLP) wurde die Veränderung der Struktur der Bakteriengemeinschaft untersucht und eine starke Zunahme von Sphingobacteriaceae in der thermophilen Phase beobachtet. Die Untersuchungen durch ARDRA, Chinonanalytik und Fluoreszenz in situ Hybridisierung (FISH) zeigten, dass Vertreter der Firmicutes und Bacteriodetes den größten Anteil der Bakterien darstellten. Weiterhin wurde mittels quantitativer PCR (q-PCR) die Populationsdynamik ausgewählter Bakterien verfolgt.; Biowaste including animal material was composted in 400- to 700 l bioreactors. Twenty-five thermophilic and 19 mesophilic or thermotolerant bacteria were isolated from different composting processes. We selected and characterized different strains for their potential use as starter cultures. The diversity of the bacterial community in three different composting processes were analysed by restriction analysis of amplified 16S rRNA genes (ARDRA). Changes in the community structure during the composting process were monitored by terminal restriction fragment length polymorphism (t-RFLP) of 16S rRNA genes indicating the strong increase of Sphingobacteriaceae in the thermophilic phase. Studies by ARDRA, Quinone analysis and fluorescence in situ hybridisation (FISH) demonstrated that most of the bacteria belonged to the Firmicutes and Bacteriodetes. The population dynamics of selected bacteria was followed by quantitative PCR (q-PCR).

2013-01-01T00:00:00Z Hassounah, Hany https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/7197 2026-01-30T09:53:49Z 2010-01-01T00:00:00Z

Title: Investigations on the phylogenetic diversity of urease producing bacteria in soil, the inhibition of urea active transportation and metabolizing in Bacillus megaterium DSM 90 Author(s): Hassounah, Hany Abstract: In der vorliegendende Studie wurden die Auswirkungen ausgewählter Phosphorsäureamidverbindungen auf im Boden lebende, Urease-produzierende Bakteriengemeinschaften und auf die Physiologie von B. megaterium DSM90 Urease untersucht. Mittels konventionellen und metagenomischen Ansätzen wurde die Zusammensetzung der Mikroorganismengemeinschaft im Boden untersucht. Die Ergebnisse zeigten, dass der Typ und die Konzentration der eingesetzten Phosphorsäureamidverbindungen eine wichtige Rolle für die Veränderung und Gestaltung dieser Mikroorganismengemeinschaft spielten. Die Untersuchungen des aktiven Transportes von Harnstoff ins Zellinnere von B. megaterium DSM90 zeigten, dass die meisten der untersuchten Verbindungen die Harnstoffaufnahme nicht nur durch die Unterdrückung der aktiven Transporter stark inhibierten. Die bakterielle Urease von B. megaterium DSM90 wurde isoliert und durch verschiedene Downstream-Verfahren aufgereinigt. Die Charakterisierung der Inhibierung der Urease durch die verwendeten Phosphoramidverbindungen zeigte, dass alle getesteten Verbindungen Urease mit einem KI Wert von weniger als 0,02 nM nicht-kompetitive inhibieren.

2010-01-01T00:00:00Z